O Instituto de Inovação para o Desenvolvimento Rural Sustentável de Alagoas (Emater) integra o Sistema da Secretaria de Estado da Agricultura, Pecuária, Pesca e Aquicultura (Seagri), assim como a Agência de Defesa e Inspeção Agropecuária (ADEAL), o Instituto de Terras e Reforma Agrária (ITERAL), e o Instituto de Desenvolvimento Rural e Abastecimento (Ideral).